选用不同染色体上的８个微卫星位点，应用ＰＣＲ技术对１０个品系的近交系小鼠进行遗传分析，研究结果表明：在无任何亲缘关系的近交系小鼠品系之间，该８个微卫星位点均具有不同的等位基因。含有不同等位基目的微卫星位点所占的百分比从ＭＳＭ／ＭＳ与Ｃ３Ｈ／ＨｅＪ的１００％到（ＣｘＳ）Ｆ与Ｃ５７ＢＬ／６Ｊ间的２５％，平均５６．７２％，在重组近交系间及重组近交系与亲本之间，此比率从（ＣｘＳ）Ｄ或（ＣｘＳ）Ｍ与ＢＡＬＢ／ＣＨｅＡ间的５０％到（ＣｘＳ）Ｄ或（ＣｘＳ）Ｍ与ＳＴＳ／Ａ，（ＣｘＳ）Ｄ与（ＣｘＳ）Ｍ间的２５％，此８个微卫星位点有可能做为在基因水平上进行近交系小鼠遗传监测的标记。