摘要: 目的 DNA 甲基化微单倍型是指极短范围内多个甲基化位点的组合,其单倍型具有丰富的多样性。筛选和验证小鼠血液中年龄相关的 DNA 甲基化微单倍型。 方法 首先,构建基于小鼠参考基因组的 DNA 甲基化微单倍型理论数据集。 其次,利用网络数据库中小鼠血液 DNA 甲基化高通量测序信息,采用 Spearman 秩相关分析方法筛选年龄相关的 DNA 甲基化微单倍型。 最后,以验证数据集交叉验证。 结果 小鼠基因组中 50 bp 范围内的DNA 甲基化微单倍型位点数量共计 6787 142 个,由个位数的 CpG 位点所组成的 DNA 甲基化微单倍型占比98. 64%。 在 58 个小鼠血液样本中共筛选出 5835 个年龄相关的 DNA 甲基化微单倍型( Spearman 秩相关检验,|rho | > 0. 5, P<0. 01),在 DNA 甲基化微单倍型中占 0. 086%。 最后,在 95 例独立的样本中对具有高相关性的前100 个年龄相关的 DNA 甲基化微单倍型进行验证,最终得到 44 个位点。 结论 本研究筛选出的年龄相关的 DNA甲基化微单倍型可以为后续小鼠血液表观年龄预测及衰老研究提供借鉴。
