影响公众健康的复杂性疾病，如癌症、心脑血管病、糖尿病和痴呆等，多源自遗传、发育、环境等诸多因素的相互作用，但影响遗传变异的机理大多未知。为此人们开始研究一项新的模拟人类遗传结构的实验资源，被称为复杂性状遗传CC小鼠（以下简称CC小鼠）。CC小鼠是一个多亲本的遗传参考种群，其基础是充分利用重组近交系，可以快速定位调节复杂性状基因。设计用八个始建品系来解决对遗传变异的限制，其中包括数个来源于不同大洲的野生近交品系。可创造更多的重组近交系突破基因图绘制效力的限制。项目期望目标是建立1000个品系来获得更高的绘图分辨率和精确的基因图谱。CC小鼠是一项极有价值的研究来探索只能在动物体内确定的性状。最早的繁育中心分别位于澳大利亚、美国和肯尼亚（后迁到以色列）。选取三个起源于日本和新西兰的基因组已被测序的品系、二个作为自身免疫模型和肥胖模型的品系、三个来源于野生品系的小鼠亚种，这些始建品系具有小鼠多样性等位基因的90%且可覆盖基因组1Mb的区域。八个始建品系可以形成56种杂交组合，都来源于G2代小鼠独一无二的交配组合，具有更多的变异位点，因此品系中的自然遗传变异具有更高的表型多样性且不像诱变和敲除一样会导致突变减弱。目前世界上有近200个可用品系，可为相关研究提供强大的资源。