鼠痘病毒 FQ-PCR 检测方法的建立及初步应用
作者:
作者单位:

中国食品药品检定研究院,北京 102629

中图分类号:

R-33


Development of an FQ-PCR method to detect and quantitate ectromelia virus and primary applications
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Affiliation:

National Institute for Food and Drug Control, Beijing 102629, China

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    摘要:

    目的 建立鼠痘病毒(ECTV)的 TaqMan 探针法荧光定量 PCR 检测方法,并对实验室保存的裸鼹鼠组织样本、小鼠组织样本以及黄鼠组织样本进行检测。 方法 根据 GenBank 中鼠痘病毒的 crmD 基因序列设计引物探针,建立 ECTV 的 FQ-PCR 检测方法,对保存的样本进行筛查,并对部分阳性样本进行测序鉴定。 结果 建立的 ECTV FQ-PCR 检测方法灵敏度高、特异性强,最低能检测到 ECTV 核酸浓度为 10 copies/ μL 的样本,方法的标准曲线相关参数符合标准。 使用该方法检测实验室 63 份裸鼹鼠脾组织样本和 22 份小鼠脾组织样本,结果全为阴性,检测 4 只黄鼠组织样本,结果阳性率为 50%。 阳性样本进行 PCR 检测后测序比对为 ECTV 核酸序列。 结论 经验证,建立的 ECTV FQ-PCR 检测方法能够灵敏特异的对样本中的 ECTV 进行筛查,实验室小鼠的日常监测不应忽视 ECTV 污染的潜在风险。

    Abstract:

    Objective To identify the prevalence of ECTV in mice. Methods A sensitive and specific FQ-PCR assay for ECTV was developed and used to detect and quantitate ECTV in mouse samples by analyzing the sequence of the crmD gene in ECTV. Results This assay detected a minimum of 10 copies of standard DNA. The assay was applied to 63 naked mole rat spleen samples and 22 mouse spleen samples raised in the laboratory, which provided negative result . In tissue samples from four ground squirrels raised in our laboratory, the positive rate was 50%. Some positive samples amplified with primers for the crmD gene had 99% similarities to ECTV as determined by sequencing the PCR products. Conclusions Our result suggest that routine surveillance of ECTV in laboratory mice cannot be ignored.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

王莎莎,付 瑞,王 吉,岳秉飞.鼠痘病毒 FQ-PCR 检测方法的建立及初步应用[J].中国比较医学杂志,2021,31(1):101~105.

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  • 收稿日期:2020-05-29
  • 在线发布日期: 2021-03-02
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